217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0021 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0021  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 428 aa  883    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0548  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0032157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1074  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 440 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00779107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.65 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1505  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.73 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.28 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0604  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.293813 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1305  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1306  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.74 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.74 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.41 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.73 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.82 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  30.58 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.06 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.75 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.95 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.95 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  22.45 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  21.07 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  20.99 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 483 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  21.47 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.19 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.6 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 452 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  21.63 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  21.74 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  30.95 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.34 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.75 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  21.74 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  22.5 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 415 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 431 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  25.5 
 
 		 426 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 420 aa  50.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  22.22 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>