119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1334 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1334  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000527962 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1332  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000172519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.85 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  31.03 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  25.66 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  25.66 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  25.68 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  26.21 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  25 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  31.08 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  27.66 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2560  UspA domain protein  22.97 
 
 		 345 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  25 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  22.14 
 
 		 297 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  26.83 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  27.33 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  28 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  22.14 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  26.21 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  27.59 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  26.39 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  26.95 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  25.17 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  25.85 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  25 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  26 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  24 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  24 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2397  hypothetical protein  24.46 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  21.19 
 
 		 314 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  24 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1300  hypothetical protein  26.42 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000102355 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  27.08 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  27.08 
 
 		 296 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.52 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  21.43 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  25.17 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  25.34 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  26.53 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  23.57 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  24.49 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  23.84 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  24.29 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  26.21 
 
 		 287 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  25 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  24.66 
 
 		 133 aa  44.3  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  28.28 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.68 
 
 		 320 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  24.55 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  21.99 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  24.16 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  20.42 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  26.53 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  23.08 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  26.17 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  23.33 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  25.93 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  21.38 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  26.9 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  25.87 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  22.82 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  25 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  22.37 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  23.68 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  21.83 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  22.76 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  22.14 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  23.24 
 
 		 144 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  23.36 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 291 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  23.33 
 
 		 151 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 140 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  23.38 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  20.83 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  23.03 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  31.11 
 
 		 282 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  26.57 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  20.57 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  31.82 
 
 		 283 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  24.18 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  23.81 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  21.29 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>