78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3646 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 151 aa  295  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  61.31 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  58.99 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  49.65 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 180 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 202 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  46.36 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  39.55 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 189 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 189 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 189 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  43.3 
 
 		 147 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  42.72 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  42.72 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  43.27 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  35.07 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 322 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  29.51 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  22.73 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  32.06 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  27.62 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  29.46 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 352 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 156 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.4 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  34.25 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.4 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  28.3 
 
 		 175 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 172 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 159 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>