More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1889 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 198 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  73.91 
 
 		 188 aa  286  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  65.43 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  55.8 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  52.58 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  51.31 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  52.22 
 
 		 190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  43.01 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  38.27 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  37.04 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  38.07 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  38.29 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  34.86 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 169 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  36.22 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  36.16 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 219 aa  88.2  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  34.81 
 
 		 198 aa  87.8  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  36.16 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  35.39 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  34.5 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  36.93 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  35.43 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  36.81 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  35.2 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  26.44 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.01 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  31.74 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2586  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000628471  hitchhiker  0.000111842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  25.88 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  24.43 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  24.43 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  28.26 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  28.93 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  26.16 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  29.11 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  28.93 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  28.93 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  28.93 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  28.93 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  28.93 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  23.86 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  23.9 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  30.19 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.01 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  22.99 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>