144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0741 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  100 
 
 		 457 aa  913    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  32.37 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0020  conjugation TrbI-like protein  32.21 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  51.49 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  31.58 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  33.65 
 
 		 437 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  32.54 
 
 		 437 aa  117  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  33.65 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  32.09 
 
 		 410 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  33.49 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  32.08 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  29.09 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  30.77 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  31.63 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  33.63 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  29.89 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  29.12 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  29.12 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  32.51 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  32.06 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  33.18 
 
 		 444 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  30.23 
 
 		 445 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  32.51 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  33.99 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  28.96 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  29.05 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  31.88 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  29.26 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  27.58 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  30.73 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  31.55 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  30.92 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  31.88 
 
 		 411 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  30.43 
 
 		 399 aa  96.7  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  30.92 
 
 		 384 aa  96.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  29.3 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  30.52 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  31.36 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  25.66 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  28.85 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  30.43 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  28.02 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  29.61 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  25.21 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  30.43 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  28.37 
 
 		 425 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  28.38 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  30.14 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  25.94 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  29.47 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  28.37 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  28.37 
 
 		 423 aa  93.2  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  30 
 
 		 400 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  28.37 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  28.37 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  27.72 
 
 		 427 aa  93.2  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  29.67 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  28.5 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  28.5 
 
 		 467 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  27.88 
 
 		 423 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  28.04 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  27.41 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  28.83 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  27.88 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  27.88 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  29.52 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  28.37 
 
 		 424 aa  90.9  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  26.83 
 
 		 391 aa  90.5  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  30.77 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  28.64 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  28.85 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  29.61 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  28.5 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  29.05 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  23.7 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  27.54 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  24.77 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  30.95 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  28.02 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  26.92 
 
 		 378 aa  87  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  28.99 
 
 		 383 aa  87  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  28.37 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  27.16 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  27.67 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  24.56 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  26.39 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  27.18 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  29.81 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  28.1 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  28.97 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  27.54 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  27.18 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  29.21 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>