More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1060 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  58.6 
 
 		 217 aa  262  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  48.58 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  40.09 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.57 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  40.29 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 240 aa  98.6  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 184 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 194 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 189 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 193 aa  85.1  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.62 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  30.98 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  29.83 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  34.29 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 188 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  27.64 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  30.22 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  30.98 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4137  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  26.52 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>