153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0370 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  100 
 
 		 918 aa  1879    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  36.08 
 
 		 593 aa  288  5e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  34.08 
 
 		 759 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  31.15 
 
 		 1222 aa  227  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  30.75 
 
 		 1567 aa  224  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  31 
 
 		 797 aa  212  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  31.43 
 
 		 638 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  31.82 
 
 		 858 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  31.82 
 
 		 805 aa  208  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.44 
 
 		 858 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  31.82 
 
 		 800 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.44 
 
 		 858 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  31.82 
 
 		 800 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  31.63 
 
 		 807 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  30.43 
 
 		 781 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  30.43 
 
 		 781 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  31.06 
 
 		 806 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  31.06 
 
 		 806 aa  199  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  31.06 
 
 		 806 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  31.06 
 
 		 806 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 806 aa  199  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 806 aa  199  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  31.06 
 
 		 806 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  29.59 
 
 		 1100 aa  188  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  27.81 
 
 		 1000 aa  189  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  29.92 
 
 		 806 aa  187  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  27.24 
 
 		 909 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  27.24 
 
 		 947 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  31.31 
 
 		 831 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  24.88 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  24.39 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  25.98 
 
 		 671 aa  131  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  25.41 
 
 		 652 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  25.41 
 
 		 652 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  42.86 
 
 		 613 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  42.75 
 
 		 978 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  44.12 
 
 		 1206 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  40 
 
 		 644 aa  109  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  37.2 
 
 		 14944 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1504 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  38.17 
 
 		 841 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  25.28 
 
 		 1141 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02420  glyoxal oxidase precursor, putative  25.42 
 
 		 631 aa  92.8  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  26.73 
 
 		 1172 aa  90.9  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  34.8 
 
 		 1199 aa  87.4  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  41.18 
 
 		 2252 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  44.04 
 
 		 831 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  30.6 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.38 
 
 		 904 aa  84.3  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  27.07 
 
 		 757 aa  83.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  34.44 
 
 		 995 aa  82.4  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  36.62 
 
 		 2215 aa  79.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  36.67 
 
 		 1293 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  39.13 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  30.37 
 
 		 2392 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.99 
 
 		 1160 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.14 
 
 		 1064 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  27.38 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  37.39 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05040  glyoxal oxidase precursor, putative  23.31 
 
 		 676 aa  74.7  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.121305  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  36.43 
 
 		 966 aa  75.1  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  29.69 
 
 		 4465 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  38.52 
 
 		 1314 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  32.39 
 
 		 1042 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.79 
 
 		 795 aa  70.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.19 
 
 		 9585 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  24.4 
 
 		 915 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  30.64 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  31.85 
 
 		 2447 aa  67.8  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  25 
 
 		 914 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2485  Protein of unknown function DUF1588  29.86 
 
 		 778 aa  66.6  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.474006  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03960  glyoxal oxidase precursor, putative  22.09 
 
 		 664 aa  65.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.270236  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  27.71 
 
 		 882 aa  64.7  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  35.42 
 
 		 1380 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  30.89 
 
 		 1363 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  27.71 
 
 		 882 aa  63.9  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 		 886 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  30.69 
 
 		 211 aa  63.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  33.16 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  24.1 
 
 		 1236 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  27.27 
 
 		 3802 aa  62  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  29.41 
 
 		 1363 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  37.76 
 
 		 578 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 		 875 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  25.25 
 
 		 779 aa  59.7  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  34.56 
 
 		 772 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  33.93 
 
 		 782 aa  60.1  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  31.29 
 
 		 1113 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  28.65 
 
 		 1067 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  31.25 
 
 		 3507 aa  58.9  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 		 913 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.95 
 
 		 2334 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  36 
 
 		 897 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.94 
 
 		 834 aa  57.4  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  30.46 
 
 		 1628 aa  57.4  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.36 
 
 		 950 aa  56.2  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  23.79 
 
 		 484 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  25.17 
 
 		 849 aa  57  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 1973 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  33.09 
 
 		 906 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>