More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1754 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  100 
 
 		 834 aa  1696    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 874 aa  311  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  29.27 
 
 		 827 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 852 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 875 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 871 aa  301  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 849 aa  294  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 861 aa  293  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 861 aa  292  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 861 aa  292  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 944 aa  290  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 861 aa  287  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 861 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 861 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 928 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 857 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 869 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  29.92 
 
 		 877 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 901 aa  280  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 927 aa  280  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 855 aa  275  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  30.08 
 
 		 880 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 847 aa  268  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 879 aa  266  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 953 aa  262  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 906 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 906 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 906 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 913 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 941 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 941 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 941 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 924 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 924 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 924 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 914 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 890 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 890 aa  244  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 884 aa  243  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 935 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 893 aa  237  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 838 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 867 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 867 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 910 aa  233  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 867 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 903 aa  231  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 867 aa  231  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  28.16 
 
 		 853 aa  230  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 842 aa  230  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 866 aa  230  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 891 aa  229  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 904 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 869 aa  229  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 855 aa  228  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  27.75 
 
 		 839 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 855 aa  227  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 904 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 872 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 873 aa  224  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 904 aa  224  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 843 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 853 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 896 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 841 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 836 aa  222  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 883 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 883 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 904 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 925 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  26.54 
 
 		 922 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 883 aa  218  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 869 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 873 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 854 aa  216  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0404  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 896 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0380405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  25.91 
 
 		 895 aa  212  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.15 
 
 		 884 aa  212  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 901 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 897 aa  210  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 907 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 950 aa  208  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 817 aa  208  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 907 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  27.24 
 
 		 866 aa  205  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 909 aa  201  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  25.63 
 
 		 914 aa  195  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 912 aa  194  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 876 aa  194  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 954 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2669  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 800 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 973 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 882 aa  191  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 935 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 909 aa  187  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 946 aa  187  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 882 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 886 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 908 aa  185  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>