More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0928 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  100 
 
 		 574 aa  1169    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.46 
 
 		 558 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.46 
 
 		 556 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.94 
 
 		 563 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.79 
 
 		 561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.79 
 
 		 561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.79 
 
 		 561 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.13 
 
 		 559 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  31.13 
 
 		 559 aa  153  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  32.46 
 
 		 559 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  32.46 
 
 		 559 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  31.13 
 
 		 560 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.66 
 
 		 567 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  29.5 
 
 		 569 aa  150  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  30.57 
 
 		 549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  30.1 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  31.6 
 
 		 609 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  26.08 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.93 
 
 		 562 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  29.18 
 
 		 561 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  26.65 
 
 		 572 aa  140  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  28.76 
 
 		 559 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  28.22 
 
 		 530 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  29.51 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  27.92 
 
 		 546 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  31.17 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  24.48 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  27.24 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.43 
 
 		 506 aa  126  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  24.52 
 
 		 508 aa  126  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  23.37 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  28.53 
 
 		 577 aa  125  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.1 
 
 		 830 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  28.79 
 
 		 614 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  27.62 
 
 		 543 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  25.85 
 
 		 547 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  25.55 
 
 		 546 aa  123  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  21.85 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  21.85 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  24.89 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  26.71 
 
 		 512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  22.47 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  26.25 
 
 		 554 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  23.18 
 
 		 541 aa  115  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  24.68 
 
 		 581 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  27.91 
 
 		 539 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  23.75 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  28.4 
 
 		 740 aa  104  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  27.6 
 
 		 569 aa  104  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  23.85 
 
 		 625 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 733 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  24.28 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  24.72 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0500  type II secretion system protein, putative  22.76 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  24.94 
 
 		 412 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  24.06 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  24.06 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  27.09 
 
 		 775 aa  98.2  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  26.76 
 
 		 775 aa  96.7  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  23.84 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  24.33 
 
 		 386 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  23.84 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  23.84 
 
 		 412 aa  93.6  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  23.08 
 
 		 893 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  24.84 
 
 		 781 aa  90.5  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  25.38 
 
 		 810 aa  90.5  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  24.6 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  24.43 
 
 		 426 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  22.98 
 
 		 874 aa  89.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  26.49 
 
 		 767 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  28.3 
 
 		 756 aa  88.6  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  29.5 
 
 		 787 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  23.39 
 
 		 426 aa  87.8  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  23.87 
 
 		 657 aa  87.8  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0329  type IV pilus secretin PilQ  24.22 
 
 		 987 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00519282  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  24.2 
 
 		 426 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  28.12 
 
 		 776 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  24.53 
 
 		 781 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  28.89 
 
 		 793 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  23.36 
 
 		 580 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  29.17 
 
 		 819 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  25.84 
 
 		 766 aa  85.5  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  26.38 
 
 		 594 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  27.15 
 
 		 833 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  28.47 
 
 		 763 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  23.2 
 
 		 718 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  22.98 
 
 		 882 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.32 
 
 		 829 aa  84.7  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  26.87 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  23.08 
 
 		 887 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  25.09 
 
 		 779 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  24.59 
 
 		 736 aa  83.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  23.16 
 
 		 718 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  24.61 
 
 		 699 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  23.77 
 
 		 692 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  25.61 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  21.7 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  22 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  23.21 
 
 		 684 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  22.87 
 
 		 887 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>