More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1787 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
543 aa  1080    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  47.33 
 
 
602 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  42.25 
 
 
1694 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
1276 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.01 
 
 
927 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  38.12 
 
 
562 aa  365  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.81 
 
 
810 aa  326  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  54.46 
 
 
344 aa  325  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
878 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  37.68 
 
 
1979 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
4079 aa  316  6e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.47 
 
 
1022 aa  293  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  45.73 
 
 
573 aa  291  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  38.44 
 
 
617 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.82 
 
 
1056 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.75 
 
 
818 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  33.92 
 
 
1138 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.73 
 
 
1056 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  30.7 
 
 
564 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
1049 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 
784 aa  259  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.15 
 
 
784 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.56 
 
 
988 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  31.71 
 
 
635 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.5 
 
 
707 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  33.41 
 
 
955 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 
4489 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
1069 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
711 aa  246  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.46 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
591 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.1 
 
 
462 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.36 
 
 
632 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
465 aa  239  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
366 aa  236  6e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.54 
 
 
576 aa  236  7e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  29.94 
 
 
1013 aa  226  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
804 aa  225  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
1737 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 
425 aa  225  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
3035 aa  223  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
634 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  35 
 
 
745 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.27 
 
 
706 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
414 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.24 
 
 
730 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
750 aa  217  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
1094 aa  217  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
935 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.3 
 
 
706 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  36.7 
 
 
1007 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
605 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
329 aa  204  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  28.6 
 
 
1056 aa  202  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
687 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 
409 aa  200  7e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.5 
 
 
1067 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 
1192 aa  199  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  36.76 
 
 
795 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  30.23 
 
 
436 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  29.42 
 
 
1676 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
740 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.74 
 
 
292 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
1276 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
409 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  44.4 
 
 
512 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
3560 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
450 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
649 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  36.33 
 
 
623 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 
758 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
3172 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 
761 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
909 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  40.27 
 
 
523 aa  186  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
1054 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  44.78 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  37.03 
 
 
356 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
467 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 
1297 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
388 aa  177  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.54 
 
 
816 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 
662 aa  177  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
594 aa  177  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
393 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 
685 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.68 
 
 
732 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
393 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
391 aa  173  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 
352 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  38.56 
 
 
279 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 
486 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  36.21 
 
 
314 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
375 aa  171  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 
681 aa  170  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.74 
 
 
725 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 
1421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>