More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1685 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  61.26 
 
 		 562 aa  714    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  94.42 
 
 		 573 aa  1068    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0215  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  94.59 
 
 		 573 aa  1070    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  100 
 
 		 573 aa  1145    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  79.41 
 
 		 573 aa  932    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  38.23 
 
 		 567 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.33 
 
 		 552 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  36.44 
 
 		 547 aa  362  9e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  37.11 
 
 		 568 aa  360  5e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  36.65 
 
 		 548 aa  352  1e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.51 
 
 		 553 aa  348  1e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  35.2 
 
 		 546 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.27 
 
 		 550 aa  343  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.45 
 
 		 556 aa  330  6e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.66 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.48 
 
 		 610 aa  306  9.000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.06 
 
 		 594 aa  286  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.45 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.22 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  30.35 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  30.68 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  30.18 
 
 		 584 aa  261  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  32.5 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  30.02 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  30.29 
 
 		 603 aa  242  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.67 
 
 		 531 aa  237  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  30.21 
 
 		 549 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  29.87 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.41 
 
 		 601 aa  231  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  28.1 
 
 		 576 aa  230  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0780  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.18 
 
 		 582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.98 
 
 		 583 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.36 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  28.71 
 
 		 803 aa  219  7.999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  28.01 
 
 		 513 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  27.29 
 
 		 511 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  28.66 
 
 		 507 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.81 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  25.79 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  26.19 
 
 		 508 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  25.47 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  25.47 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  25.47 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.28 
 
 		 1017 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  29.82 
 
 		 507 aa  196  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  25.13 
 
 		 534 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  26.54 
 
 		 527 aa  193  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  26.19 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  27.11 
 
 		 513 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  32.49 
 
 		 512 aa  188  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.53 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  27.54 
 
 		 719 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.92 
 
 		 522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0096  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.1 
 
 		 506 aa  177  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0228406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.23 
 
 		 592 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  28.22 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  31.14 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06069  DNA ligase (Eurofung)  24.78 
 
 		 932 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16988  predicted protein  26.88 
 
 		 664 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606353  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4586  ATP-dependent DNA ligase  27.88 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04883  DNA ligase (Eurofung)  25.19 
 
 		 816 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.125619 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  29.34 
 
 		 546 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  30.14 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4933  ATP dependent DNA ligase  27.58 
 
 		 442 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_51005  predicted protein  23.89 
 
 		 651 aa  146  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  30.48 
 
 		 545 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  25.16 
 
 		 530 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  27 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  28.85 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  30.68 
 
 		 546 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  25.77 
 
 		 550 aa  136  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  26.7 
 
 		 558 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  24.81 
 
 		 544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  29.85 
 
 		 552 aa  130  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  29.75 
 
 		 584 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  29.01 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  25.05 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  28.84 
 
 		 532 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  29.7 
 
 		 561 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  29.36 
 
 		 558 aa  123  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  28.27 
 
 		 566 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  29.25 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  23.42 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  27.93 
 
 		 552 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  26.83 
 
 		 559 aa  120  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  29.1 
 
 		 534 aa  120  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  24.5 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3873  ATP-dependent DNA ligase  27.3 
 
 		 567 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.537943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  24.5 
 
 		 533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  21.73 
 
 		 535 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  26.22 
 
 		 559 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  24.76 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  28.65 
 
 		 622 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  24.05 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  24.11 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4135  DNA ligase, ATP-dependent  27.56 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  25.54 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  27.16 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2804  ATP-dependent DNA ligase  29.39 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414276  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  28.53 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>