More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4147 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 218 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 218 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  80.73 
 
 		 218 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0365  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0217747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  37.86 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6854  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.101929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  44.59 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 403 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.83 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  24.77 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  40.45 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>