99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01208 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  47.3 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  37.2 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  35.02 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  36.64 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  35.07 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  35.58 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  34.47 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  31.89 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  31.82 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  30.48 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  36.15 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  34.93 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  36.06 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  31.25 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  32.13 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  34.6 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  33.73 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  28.01 
 
 		 285 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  32.77 
 
 		 240 aa  94.7  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  32.77 
 
 		 240 aa  94.7  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  29.87 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  31.97 
 
 		 245 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1469  hypothetical protein  28.8 
 
 		 250 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2608  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2465  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2470  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1338  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02199  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  28.89 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.320198 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1342  Phosphogluconate dehydratase  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363237  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3454  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2692  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02239  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2606  hypothetical protein  28.51 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2506  hypothetical protein  28.51 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2715  hypothetical protein  28.51 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2552  hypothetical protein  29.86 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  28.89 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  36.61 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  36.29 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  42.67 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  43.42 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  43.42 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  38.16 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  29.95 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  29.11 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  36.49 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  26.19 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  27.63 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  29.11 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  25.99 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3330  hypothetical protein  34.15 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.379466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  27.5 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  29.36 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  27.5 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  27.73 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  30.41 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  31.53 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  23.94 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  25.57 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  32.86 
 
 		 267 aa  51.6  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  25.11 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1276  hypothetical protein  29.08 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00928354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  27.27 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  30.56 
 
 		 345 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  30.26 
 
 		 424 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  28.11 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  26.09 
 
 		 328 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  36 
 
 		 574 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  35.21 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  24.1 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  36 
 
 		 574 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  35.21 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  26.63 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  35.21 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  35.21 
 
 		 319 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  35.21 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  35.21 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  35.21 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  35.21 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  35.21 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  31.65 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  23.08 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  35.71 
 
 		 346 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34170  Sporulation related repeat protein  30.77 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  34.72 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  34.72 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  34.72 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  34.72 
 
 		 325 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  34.72 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2462  hypothetical protein  27.98 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.369037 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0874  sporulation related  28.36 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0365058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  31.25 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  30.56 
 
 		 344 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  33.9 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3761  Sporulation domain protein  30.59 
 
 		 290 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2685  sporulation related  29.17 
 
 		 257 aa  41.6  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>