20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1276 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1276  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  448  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00928354  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0573  Sporulation domain protein  30.65 
 
 
240 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.335312  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0491  hypothetical protein  31.39 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1139  hypothetical protein  28.91 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1352  hypothetical protein  25.94 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000573992  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0428  hypothetical protein  23.44 
 
 
278 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.118569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0453  hypothetical protein  22.79 
 
 
278 aa  62  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1553  hypothetical protein  22.34 
 
 
278 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1648  hypothetical protein  33.88 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0228  ABC transporter ATP-binding protein  38.89 
 
 
297 aa  52.4  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  34.78 
 
 
370 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  29.08 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0705  sporulation domain-containing protein  37.93 
 
 
372 aa  48.5  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  35.14 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1500  Sporulation domain protein  29.63 
 
 
262 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6008  hypothetical protein  33.75 
 
 
315 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0252  sporulation domain-containing protein  33.75 
 
 
315 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  31.82 
 
 
243 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  29.75 
 
 
274 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>