17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6008 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6008  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0252  sporulation domain-containing protein  96.83 
 
 		 315 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0280  sporulation domain-containing protein  56.56 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1568  sporulation related  48.15 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2982  hypothetical protein  49.25 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059569  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2218  sporulation domain-containing protein  57.69 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0549  hypothetical protein  44.79 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2200  sporulation domain-containing protein  44.79 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  30.86 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  38.98 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  38.98 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  38.98 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  39.73 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  33.8 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1276  hypothetical protein  33.75 
 
 		 227 aa  42.7  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00928354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3565  sporulation domain-containing protein  38.46 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  35.06 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>