208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1524 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  100 
 
 
143 aa  280  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  56.21 
 
 
151 aa  143  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3734  UspA domain protein  41.13 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  38.78 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  38.03 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  39.31 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  37.93 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  33.57 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  37.41 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  40.82 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  39.58 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  39.58 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  36.73 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  40.71 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1965  UspA domain protein  37.93 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  39.01 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  38.57 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  34.04 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  34.48 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  35.92 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  34.21 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  33.8 
 
 
295 aa  66.6  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  34.67 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  37.16 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  32.03 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  33.33 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  32.24 
 
 
295 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  35.97 
 
 
137 aa  60.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  33.59 
 
 
297 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.57 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  37.86 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  36.05 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.33 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.33 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  37.93 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  31.25 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  31.91 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  34.87 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.57 
 
 
288 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.77 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  34.72 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  33.78 
 
 
147 aa  53.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  32.17 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  31.58 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  32.64 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  29.73 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  32.37 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  32.19 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.25 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.87 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  36.64 
 
 
469 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.67 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  32.89 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.67 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
297 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  30.82 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  32.43 
 
 
294 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
143 aa  50.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.33 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.33 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  32.39 
 
 
291 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  31.39 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  30.34 
 
 
151 aa  50.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  33.79 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.76 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  32.68 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.68 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.66 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  32.69 
 
 
305 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  31.87 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  30.07 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  31.58 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  26.71 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.72 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  26.39 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.54 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.11 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  26.03 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 
466 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  35.88 
 
 
466 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  30.56 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.82 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  29.25 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  33.33 
 
 
286 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  40.51 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
478 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  27.03 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.28 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.88 
 
 
287 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>