More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2792 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  100 
 
 
144 aa  289  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  79.86 
 
 
144 aa  241  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  52.05 
 
 
145 aa  136  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  49.3 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  45.95 
 
 
149 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  49.31 
 
 
150 aa  120  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  43.06 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  50.35 
 
 
140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  45 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  43.06 
 
 
147 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  45.45 
 
 
142 aa  112  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  45.16 
 
 
150 aa  110  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  44.44 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  44.14 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  42.38 
 
 
141 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  45.83 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  45.07 
 
 
136 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  43.84 
 
 
143 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  41.38 
 
 
139 aa  102  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  42.55 
 
 
138 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  40.97 
 
 
142 aa  99  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  42.07 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  43.75 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  45.64 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  40.41 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  40.28 
 
 
295 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  43.75 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.66 
 
 
150 aa  87  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  40 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  39.04 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  37.59 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  40.27 
 
 
173 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  34.39 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  36.49 
 
 
295 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  38.73 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  38.16 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.87 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  40.41 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.16 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  36.55 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.87 
 
 
156 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1687  UspA domain protein  38.19 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  35.66 
 
 
153 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.36 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  40.69 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.51 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  39.58 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.91 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  37.06 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1626  UspA domain protein  37.97 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  36.73 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  35.57 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  46.07 
 
 
290 aa  73.9  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  32.87 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.25 
 
 
297 aa  73.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  35.14 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  36.42 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.69 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.72 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34.9 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  39.22 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.53 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.49 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  31.17 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  32.21 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.53 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  36.88 
 
 
307 aa  70.1  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  36 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  34.55 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.46 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.9 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.46 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.17 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  42.11 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.67 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  34.51 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  31.82 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  32.17 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  37.5 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  32.17 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  34.46 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  31.03 
 
 
120 aa  67  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  35.62 
 
 
144 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  31.08 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  35.42 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.58 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.3 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  40.28 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.69 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>