More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4989 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  100 
 
 		 592 aa  1158    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  40.85 
 
 		 591 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  42.18 
 
 		 588 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  40.68 
 
 		 588 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  43.92 
 
 		 588 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  39.19 
 
 		 589 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  40.13 
 
 		 589 aa  382  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  40.53 
 
 		 587 aa  362  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  40.27 
 
 		 588 aa  360  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  39.8 
 
 		 591 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  39.33 
 
 		 588 aa  353  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  37.24 
 
 		 583 aa  326  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  34.4 
 
 		 596 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  34.4 
 
 		 596 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  35.18 
 
 		 593 aa  312  1e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  36.07 
 
 		 634 aa  306  9.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.38 
 
 		 602 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.38 
 
 		 596 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  37.8 
 
 		 579 aa  293  8e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.09 
 
 		 574 aa  290  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.38 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  35.93 
 
 		 575 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 		 588 aa  289  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  37.66 
 
 		 581 aa  289  9e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  34.15 
 
 		 622 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  35.35 
 
 		 592 aa  286  8e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  32.35 
 
 		 605 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.35 
 
 		 605 aa  283  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 		 607 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  33.96 
 
 		 592 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  32.55 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.72 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  33.44 
 
 		 622 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  34.15 
 
 		 605 aa  280  6e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  34.66 
 
 		 574 aa  279  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  31.99 
 
 		 575 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.74 
 
 		 601 aa  277  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 		 575 aa  273  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  32.07 
 
 		 609 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  32.89 
 
 		 583 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  32.04 
 
 		 602 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  36.12 
 
 		 572 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 		 575 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  31.62 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  31.87 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  34.15 
 
 		 574 aa  270  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.59 
 
 		 588 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  34.23 
 
 		 575 aa  269  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  33.11 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 		 574 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  32.23 
 
 		 599 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  33.51 
 
 		 602 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  34.06 
 
 		 592 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  32.05 
 
 		 574 aa  263  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.1 
 
 		 623 aa  261  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.01 
 
 		 609 aa  260  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  32.95 
 
 		 575 aa  259  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  33 
 
 		 596 aa  259  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  34.08 
 
 		 574 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  32.53 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  32.53 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  37.86 
 
 		 578 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  30.41 
 
 		 624 aa  255  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.48 
 
 		 616 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.71 
 
 		 613 aa  253  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.72 
 
 		 592 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  32.99 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  34.56 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  33.4 
 
 		 575 aa  251  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 		 574 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 		 574 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.47 
 
 		 606 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 		 574 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  34.26 
 
 		 574 aa  249  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  33.22 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  31.27 
 
 		 616 aa  247  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  34.09 
 
 		 574 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  34.68 
 
 		 627 aa  245  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.14 
 
 		 592 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.52 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.14 
 
 		 592 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.86 
 
 		 630 aa  244  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  33.66 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.69 
 
 		 610 aa  243  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.94 
 
 		 612 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.23 
 
 		 618 aa  242  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.83 
 
 		 588 aa  240  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.81 
 
 		 610 aa  239  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  31.72 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  33.66 
 
 		 609 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.51 
 
 		 611 aa  236  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.56 
 
 		 610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  31.34 
 
 		 620 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  33.57 
 
 		 599 aa  233  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.19 
 
 		 608 aa  231  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.81 
 
 		 610 aa  230  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.81 
 
 		 610 aa  230  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.81 
 
 		 610 aa  230  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.81 
 
 		 610 aa  230  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.81 
 
 		 610 aa  230  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>