More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2157 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  100 
 
 		 577 aa  1161    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  36.99 
 
 		 564 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 		 567 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  39.75 
 
 		 563 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  39.17 
 
 		 575 aa  362  8e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  40.47 
 
 		 564 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  38.04 
 
 		 571 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 574 aa  359  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  39.54 
 
 		 563 aa  359  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  39.37 
 
 		 563 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  37.12 
 
 		 571 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  38.23 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.09 
 
 		 575 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  37.52 
 
 		 568 aa  349  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  34.24 
 
 		 548 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 572 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  33.51 
 
 		 563 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  32.8 
 
 		 568 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  30.59 
 
 		 567 aa  278  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  31.1 
 
 		 568 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  31.02 
 
 		 561 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  30.07 
 
 		 565 aa  230  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  28.27 
 
 		 565 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 567 aa  221  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  28.35 
 
 		 567 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 365 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  32.22 
 
 		 393 aa  216  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  27.12 
 
 		 577 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  27.29 
 
 		 577 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  27.24 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 390 aa  199  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  33.85 
 
 		 378 aa  198  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 367 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  27.85 
 
 		 383 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  25 
 
 		 550 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 373 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  30.21 
 
 		 369 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.76 
 
 		 385 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  28.72 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 		 504 aa  130  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.6 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  28.37 
 
 		 380 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.85 
 
 		 384 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  25.07 
 
 		 380 aa  124  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  23.85 
 
 		 380 aa  123  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  26.8 
 
 		 380 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  25.07 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.15 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  27.44 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  23.59 
 
 		 380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  31.15 
 
 		 513 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  41.3 
 
 		 285 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  31.75 
 
 		 415 aa  120  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  24.64 
 
 		 380 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  24.64 
 
 		 380 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  37.93 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 418 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.78 
 
 		 371 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.31 
 
 		 394 aa  114  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  24.31 
 
 		 415 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.38 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 371 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  21.36 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  46.61 
 
 		 457 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  20.68 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  24.88 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  26.39 
 
 		 396 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0208  response regulator receiver domain-containing protein  22.53 
 
 		 564 aa  106  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  47.46 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  26.93 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  45.38 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  35 
 
 		 204 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  46.22 
 
 		 457 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.9 
 
 		 454 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  46.22 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.45 
 
 		 380 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  25.93 
 
 		 423 aa  104  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  45.38 
 
 		 466 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  42.15 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  24.75 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  37.58 
 
 		 403 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  35.33 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  45.38 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.13 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.88 
 
 		 584 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.76 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  38.56 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  44.63 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>