More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1416 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  100 
 
 
843 aa  1593    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  51.72 
 
 
843 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  43.38 
 
 
850 aa  601  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  43.51 
 
 
847 aa  595  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  41.7 
 
 
849 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  43.82 
 
 
847 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  45.61 
 
 
839 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  45.37 
 
 
845 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  46.7 
 
 
837 aa  529  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  44.47 
 
 
870 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  38 
 
 
855 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  43.32 
 
 
866 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  35.99 
 
 
841 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  29.2 
 
 
858 aa  272  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  31.39 
 
 
858 aa  257  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.69 
 
 
851 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 
842 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  31.98 
 
 
857 aa  227  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  34.74 
 
 
842 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.74 
 
 
817 aa  220  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  31.51 
 
 
846 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  25.15 
 
 
817 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.3 
 
 
849 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  25.86 
 
 
817 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  29.15 
 
 
855 aa  213  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
844 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.53 
 
 
850 aa  213  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 
849 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.99 
 
 
821 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.81 
 
 
819 aa  198  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  26.33 
 
 
878 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  29.93 
 
 
821 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  25.72 
 
 
887 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  25.53 
 
 
889 aa  190  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  25.14 
 
 
840 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  37.18 
 
 
846 aa  190  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  24.52 
 
 
865 aa  189  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  25.36 
 
 
889 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  25.33 
 
 
884 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  26.32 
 
 
845 aa  187  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  25.28 
 
 
879 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  25.93 
 
 
887 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  29.3 
 
 
857 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  27.76 
 
 
867 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
835 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  30.75 
 
 
835 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 
884 aa  177  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  29.18 
 
 
821 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  28.51 
 
 
868 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  24.68 
 
 
803 aa  167  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  30.82 
 
 
793 aa  167  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 
877 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  31.43 
 
 
853 aa  165  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  28.83 
 
 
855 aa  164  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
800 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  30.67 
 
 
877 aa  163  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  29.24 
 
 
855 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  29.49 
 
 
802 aa  140  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  36.01 
 
 
842 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 
848 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  33.52 
 
 
819 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  30.47 
 
 
836 aa  135  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  32.57 
 
 
820 aa  134  9e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.11 
 
 
843 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.29 
 
 
820 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  26.38 
 
 
836 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.43 
 
 
825 aa  129  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.64 
 
 
836 aa  129  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  32.41 
 
 
819 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  27.15 
 
 
847 aa  125  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  26.14 
 
 
852 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 
834 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  33.54 
 
 
821 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  25.26 
 
 
889 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 
861 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  27.07 
 
 
854 aa  118  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  31.48 
 
 
820 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  26.87 
 
 
849 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  25.43 
 
 
842 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  31.07 
 
 
819 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  27.6 
 
 
836 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  28.12 
 
 
841 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  25.93 
 
 
849 aa  111  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 
408 aa  111  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  24.5 
 
 
897 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1961  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 
845 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  26.93 
 
 
853 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.69 
 
 
858 aa  103  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 
859 aa  101  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 
873 aa  101  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  28.33 
 
 
850 aa  100  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  29.97 
 
 
804 aa  99.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.39 
 
 
821 aa  99  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 
445 aa  98.6  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  29.71 
 
 
753 aa  97.8  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.61 
 
 
815 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  29.6 
 
 
825 aa  97.4  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  20.83 
 
 
857 aa  97.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  31.34 
 
 
826 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  33.81 
 
 
795 aa  95.9  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>