More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2215 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  95.88 
 
 		 413 aa  764    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 413 aa  826    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  69.83 
 
 		 413 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  67 
 
 		 416 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  44.64 
 
 		 405 aa  318  9e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  42.75 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  42.75 
 
 		 426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 452 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 453 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 433 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 440 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 506 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 426 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  30.91 
 
 		 457 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  30.65 
 
 		 457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  30.64 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  31.35 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  31.12 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 442 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 440 aa  143  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 443 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 433 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 426 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 470 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 427 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 427 aa  136  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 438 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 467 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 456 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 465 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.37 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 440 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 442 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  27.11 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 432 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  33.22 
 
 		 578 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 542 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 479 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.31 
 
 		 471 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>