199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6956 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  100 
 
 		 1500 aa  3030    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  40.55 
 
 		 845 aa  540  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1523 aa  532  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  39.64 
 
 		 849 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  38.34 
 
 		 843 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  33.11 
 
 		 1509 aa  515  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1383 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  36.27 
 
 		 838 aa  483  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  37.28 
 
 		 1324 aa  479  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  35.92 
 
 		 1309 aa  453  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  33.76 
 
 		 1314 aa  423  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  29.71 
 
 		 1261 aa  389  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  35.13 
 
 		 897 aa  361  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  35.87 
 
 		 992 aa  352  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  34.87 
 
 		 900 aa  352  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  35.31 
 
 		 859 aa  346  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  35.16 
 
 		 1000 aa  342  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  30.98 
 
 		 1311 aa  321  7.999999999999999e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  32.6 
 
 		 934 aa  298  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1068 aa  289  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.18 
 
 		 829 aa  278  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  34.17 
 
 		 675 aa  277  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.48 
 
 		 899 aa  267  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 911 aa  251  9e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 785 aa  237  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  29.5 
 
 		 963 aa  237  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1010 aa  219  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  28.66 
 
 		 1056 aa  206  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1039 aa  201  7.999999999999999e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  29.63 
 
 		 1326 aa  199  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.11 
 
 		 1262 aa  197  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.23 
 
 		 1185 aa  192  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.3 
 
 		 1125 aa  189  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  27.87 
 
 		 713 aa  182  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1088 aa  181  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.05 
 
 		 1288 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 		 1283 aa  174  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.43 
 
 		 1050 aa  168  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 1424 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.35 
 
 		 801 aa  167  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.71 
 
 		 1131 aa  160  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.72 
 
 		 1128 aa  158  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1105 aa  149  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  29.37 
 
 		 686 aa  148  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  39.51 
 
 		 373 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 857 aa  143  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 924 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1404 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.34 
 
 		 1146 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24.66 
 
 		 828 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  26.02 
 
 		 793 aa  133  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 640 aa  122  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.38 
 
 		 1475 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  36.68 
 
 		 385 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  24.18 
 
 		 1468 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  28.22 
 
 		 457 aa  112  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  25.7 
 
 		 1488 aa  111  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  30.63 
 
 		 392 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 1186 aa  110  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1212 aa  108  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 966 aa  106  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 843 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  23.19 
 
 		 1136 aa  105  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.91 
 
 		 767 aa  105  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 953 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 837 aa  103  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 652 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3105  hypothetical protein  26.75 
 
 		 745 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.890364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 814 aa  100  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 671 aa  99.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1199 aa  98.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1196 aa  98.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.12 
 
 		 1550 aa  98.2  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 776 aa  97.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20.7 
 
 		 2145 aa  95.1  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  23.59 
 
 		 672 aa  94.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  22.01 
 
 		 892 aa  95.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  24.55 
 
 		 877 aa  94.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1911 aa  92.8  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 		 526 aa  90.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  25.33 
 
 		 847 aa  84.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 454 aa  84  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.92 
 
 		 1044 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  23.43 
 
 		 1228 aa  83.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.25 
 
 		 822 aa  82.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  24.85 
 
 		 916 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1017 aa  80.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0706  tetratricopeptide TPR_4  38.31 
 
 		 234 aa  79.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  21.46 
 
 		 862 aa  79.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.89 
 
 		 841 aa  78.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1215 aa  75.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0229  TIR protein  27.07 
 
 		 965 aa  73.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105613  normal  0.178125 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  22.84 
 
 		 918 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  28.52 
 
 		 1014 aa  72  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  26.79 
 
 		 822 aa  71.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  22.97 
 
 		 799 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 481 aa  69.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.27 
 
 		 1040 aa  69.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>