200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3610 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  38.04 
 
 		 188 aa  117  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7784  hypothetical protein  32.99 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0018  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  35.96 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0650  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3989  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 414 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2880  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  44.12 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4271  regulatory protein TetR  27.37 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.484179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  31.3 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  26.78 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3073  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.542296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2968  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  25.76 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  30.64 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 415 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 428 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  41.51 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  43.86 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>