More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2086 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 491 aa  941    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.09 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.79 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  47.4 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.09 
 
 		 558 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.57 
 
 		 523 aa  354  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.65 
 
 		 510 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.91 
 
 		 519 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.8 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 		 541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.42 
 
 		 517 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.54 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.39 
 
 		 509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.03 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.72 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.67 
 
 		 473 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  36.54 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  44.63 
 
 		 536 aa  280  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
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NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.04 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.11 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36 
 
 		 531 aa  269  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
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NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  42.61 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
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NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.55 
 
 		 473 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.24 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.88 
 
 		 463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_0629  major facilitator superfamily permease  35.87 
 
 		 436 aa  266  8.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.271531  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  37.38 
 
 		 540 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  32.46 
 
 		 493 aa  229  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4002  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 		 485 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1710  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.62 
 
 		 480 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460186  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.91 
 
 		 536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
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NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.27 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.21 
 
 		 484 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 		 534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 		 578 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.98 
 
 		 579 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.4 
 
 		 545 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.72 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 		 532 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 		 635 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 		 517 aa  200  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 494 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.436149 
 
 
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NC_008527  LACR_1603  major facilitator superfamily permease  29.53 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.57 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 514 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.64 
 
 		 515 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 		 515 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 		 524 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.99 
 
 		 537 aa  194  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.74 
 
 		 513 aa  194  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.66 
 
 		 492 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 544 aa  193  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 		 529 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  28.45 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  28.57 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.36 
 
 		 492 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4070  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.62 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 526 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.66 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 492 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.61 
 
 		 561 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.52 
 
 		 530 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2460  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 460 aa  191  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  27.45 
 
 		 490 aa  191  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.25 
 
 		 524 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 537 aa  189  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  32.02 
 
 		 561 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.83 
 
 		 539 aa  189  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.84 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.87 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.39 
 
 		 570 aa  187  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.52 
 
 		 520 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.93 
 
 		 529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  32.1 
 
 		 503 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  33 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  33 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.84 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 515 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.98 
 
 		 554 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
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NC_007948  Bpro_3234  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 		 522 aa  184  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201721  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.52 
 
 		 520 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.15 
 
 		 536 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 523 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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