More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1736 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  100 
 
 		 481 aa  942    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  92.96 
 
 		 483 aa  768    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  59.13 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  53.22 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  49.53 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  46.95 
 
 		 448 aa  346  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  47.09 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  46.28 
 
 		 433 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  47.03 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  46.45 
 
 		 456 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  44.31 
 
 		 437 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  41.22 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 452 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  38.65 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  40.36 
 
 		 445 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  40.85 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  39.65 
 
 		 523 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  40.85 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  40.85 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  40.85 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  39.65 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  40.85 
 
 		 523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  41.34 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.56 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  39.02 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  37.2 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  39.47 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 474 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  40.24 
 
 		 569 aa  209  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 463 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  36.34 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  38.48 
 
 		 589 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  38.84 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  39.22 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  39.27 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  37.98 
 
 		 462 aa  203  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  37.46 
 
 		 594 aa  203  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  36.44 
 
 		 469 aa  202  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  41.64 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  40.65 
 
 		 634 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  40.87 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  37.11 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  41.94 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  41.94 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  38.13 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  35.22 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  41.94 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  37.43 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  37.87 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  38.28 
 
 		 456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  38.37 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  40.05 
 
 		 455 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  39.58 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  40.05 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  37.89 
 
 		 459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  40.64 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  33.88 
 
 		 451 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  37.01 
 
 		 624 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 464 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 508 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  35.74 
 
 		 521 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  37.39 
 
 		 485 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  37.98 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 490 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  40.05 
 
 		 469 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  36.2 
 
 		 491 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  40.05 
 
 		 469 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  36.2 
 
 		 489 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  36.5 
 
 		 491 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  36.9 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  38.86 
 
 		 472 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  41.89 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  36.2 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  35.63 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  36.92 
 
 		 639 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  39.51 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  34.5 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  39.78 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  39.78 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  39.78 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  39.46 
 
 		 568 aa  194  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  39.03 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  35.91 
 
 		 504 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  32.59 
 
 		 478 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  35.61 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 454 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  35.12 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  36.8 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  37.39 
 
 		 458 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  38.9 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>