More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0364 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 377 aa  747    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  88.03 
 
 		 377 aa  664    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  92.02 
 
 		 377 aa  691    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  41.46 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40.06 
 
 		 462 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  39.5 
 
 		 432 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.67 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  40.9 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 477 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  38.31 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 440 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  35.64 
 
 		 479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 452 aa  222  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  34.85 
 
 		 410 aa  220  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.91 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.15 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  38.79 
 
 		 439 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.48 
 
 		 438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.48 
 
 		 438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.53 
 
 		 436 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.53 
 
 		 436 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  34.85 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  33.94 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 		 433 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  35.54 
 
 		 478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  35.54 
 
 		 478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 441 aa  213  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  35.75 
 
 		 422 aa  212  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  35.55 
 
 		 450 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 535 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 437 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.47 
 
 		 443 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  36.21 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.21 
 
 		 443 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  38.36 
 
 		 439 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.46 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 438 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  36 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  35.63 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  35.63 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 		 445 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  33.89 
 
 		 439 aa  209  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 		 515 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  35.08 
 
 		 445 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 		 515 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 		 515 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  36.47 
 
 		 468 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  34.25 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  34.9 
 
 		 446 aa  209  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  35.08 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  35.49 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 530 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.77 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  37.94 
 
 		 515 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  38.64 
 
 		 515 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  33.25 
 
 		 479 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  37.72 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  33.43 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  36.29 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  34.05 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  34.59 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  37.2 
 
 		 445 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  34.08 
 
 		 434 aa  206  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  37.27 
 
 		 439 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  33.07 
 
 		 480 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  37.16 
 
 		 471 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  36.26 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  38.64 
 
 		 521 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 440 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  34.24 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  38.35 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  38.35 
 
 		 530 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  38.25 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  38.35 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 		 530 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  38.35 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  38.35 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.39 
 
 		 423 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 		 550 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 		 455 aa  206  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  37.43 
 
 		 532 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  32.64 
 
 		 481 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>