158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4324 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  100 
 
 		 396 aa  830    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  36.93 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  41.64 
 
 		 363 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  32.18 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  31.88 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  30.71 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  31.56 
 
 		 391 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  25.98 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  29.61 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  31.19 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  31.68 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  26.03 
 
 		 473 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  34.1 
 
 		 216 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  30.29 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  27.27 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.97 
 
 		 401 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  32.47 
 
 		 471 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  41.09 
 
 		 147 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  29.52 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  24.91 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.39 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  25.82 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  26.98 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  31.01 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.18 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.73 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.42 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  31.78 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  25.28 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  25.69 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  27.18 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  28.14 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  23.93 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  21.92 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  25.96 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  22.99 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  28.41 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  29.08 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  22.54 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  23.38 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.38 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.32 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  21.99 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  22.68 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.19 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  27.65 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.44 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.88 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  29.56 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  28.57 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  20.79 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  22.41 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  24.86 
 
 		 338 aa  57  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  23.84 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  24.35 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.25 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.25 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.25 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  24.37 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  25.26 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  29.82 
 
 		 431 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  24.83 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  24.49 
 
 		 273 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  26.64 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.44 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  27.57 
 
 		 506 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  24.32 
 
 		 446 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  27.61 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  21.82 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  23.34 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  26.98 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.64 
 
 		 451 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0272  phage integrase  19.83 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000104155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  25.27 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.68 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2582  integrase  25.12 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000812443  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  23.4 
 
 		 413 aa  50.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  21.71 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  23.3 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  22.18 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.08 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  28.5 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  20.91 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  20.91 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  23.46 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  26.78 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2060  phage integrase family protein  22.59 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2097  phage integrase family protein  22.59 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  23.78 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>