110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0948 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  100 
 
 		 2215 aa  4418    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  31.86 
 
 		 2447 aa  546  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  25.93 
 
 		 2113 aa  90.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 2046 aa  89  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.44 
 
 		 2246 aa  85.5  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 		 2038 aa  83.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  33.33 
 
 		 14944 aa  83.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.82 
 
 		 2225 aa  82.4  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 3273 aa  82.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.07 
 
 		 2178 aa  82  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  32.21 
 
 		 361 aa  81.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  28.69 
 
 		 1531 aa  82  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  34.19 
 
 		 1504 aa  81.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  28.04 
 
 		 2585 aa  81.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  36.62 
 
 		 918 aa  79.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  26.72 
 
 		 2224 aa  79  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  26.72 
 
 		 2224 aa  79  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.72 
 
 		 2224 aa  79  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0316  PA14  27.92 
 
 		 644 aa  78.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.914268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  33.12 
 
 		 1206 aa  77.4  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  30.87 
 
 		 841 aa  76.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  30.68 
 
 		 904 aa  75.9  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4127  YD repeat protein  32.03 
 
 		 2318 aa  74.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  27.46 
 
 		 1141 aa  73.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.72 
 
 		 2221 aa  72  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1092  PA14 domain protein  27.39 
 
 		 613 aa  69.3  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  30.58 
 
 		 978 aa  68.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.41 
 
 		 1464 aa  67  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  36.36 
 
 		 3802 aa  66.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  24.1 
 
 		 1172 aa  64.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  34.19 
 
 		 886 aa  63.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  34.38 
 
 		 1293 aa  63.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1687  PA14 domain-containing protein  31.08 
 
 		 584 aa  63.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000321103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  32.73 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1352 aa  62  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.5 
 
 		 1147 aa  62  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  23.04 
 
 		 678 aa  62  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  21.44 
 
 		 1840 aa  61.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1268  PA14 domain-containing protein  30.07 
 
 		 578 aa  61.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.29777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.7 
 
 		 2350 aa  60.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  27.41 
 
 		 1314 aa  60.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28 
 
 		 1600 aa  58.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0019  PA14 domain protein  26.79 
 
 		 2392 aa  58.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000236303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  33.52 
 
 		 451 aa  58.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 2294 aa  57.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  24.24 
 
 		 765 aa  57.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.76 
 
 		 1917 aa  56.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  30.36 
 
 		 4465 aa  56.6  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  32.61 
 
 		 654 aa  56.2  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1348  PA14 domain protein  32.74 
 
 		 581 aa  55.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  23.04 
 
 		 2658 aa  55.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3221  glycoside hydrolase family protein  32.05 
 
 		 995 aa  55.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1942 aa  54.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  29.67 
 
 		 1382 aa  53.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  32.65 
 
 		 423 aa  53.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  36.29 
 
 		 831 aa  53.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.79 
 
 		 760 aa  53.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  34.12 
 
 		 2252 aa  52.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  25.07 
 
 		 2387 aa  52.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.34 
 
 		 2096 aa  52.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2374  hypothetical protein  28.92 
 
 		 772 aa  52  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.447497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  28.61 
 
 		 1953 aa  52  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1931 aa  52  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1101 aa  52  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.99 
 
 		 889 aa  51.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.22 
 
 		 3027 aa  51.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.06 
 
 		 2035 aa  51.6  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  28.38 
 
 		 1508 aa  50.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.25 
 
 		 1072 aa  49.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  30 
 
 		 569 aa  49.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.93 
 
 		 1271 aa  49.3  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0953  sulfatase  30.77 
 
 		 1414 aa  48.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.462358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.2 
 
 		 2731 aa  48.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.36 
 
 		 2349 aa  48.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  20.6 
 
 		 1732 aa  48.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1046 aa  48.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1377 aa  48.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  23.05 
 
 		 504 aa  48.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.89 
 
 		 2149 aa  48.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.64 
 
 		 1259 aa  47.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  25.15 
 
 		 1539 aa  47.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  23.18 
 
 		 2942 aa  47.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1411 aa  47.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1397 aa  47.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.05 
 
 		 2277 aa  47.8  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1485 aa  47.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  34.69 
 
 		 578 aa  47.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  31.58 
 
 		 1236 aa  47.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23 
 
 		 1520 aa  47  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  35.62 
 
 		 882 aa  47  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  35.62 
 
 		 882 aa  47  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  26.21 
 
 		 1397 aa  47  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.23 
 
 		 3333 aa  46.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  22.8 
 
 		 1485 aa  46.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.94 
 
 		 1495 aa  46.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  26.21 
 
 		 1411 aa  46.6  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.49 
 
 		 788 aa  46.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05538  putative RHS-related protein  27.33 
 
 		 818 aa  46.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.252151  normal  0.640714 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.49 
 
 		 788 aa  46.2  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  27.36 
 
 		 1345 aa  46.2  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>