More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1241 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 631 aa  1247    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 559 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 		 901 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 602 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 639 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 829 aa  183  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  35.14 
 
 		 852 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.4 
 
 		 846 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.93 
 
 		 847 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  35.64 
 
 		 847 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  35.29 
 
 		 847 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.53 
 
 		 844 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 934 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.38 
 
 		 849 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  31.87 
 
 		 842 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  33.71 
 
 		 538 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 856 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  43.2 
 
 		 499 aa  161  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 677 aa  160  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  33.05 
 
 		 855 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 930 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  31.5 
 
 		 930 aa  156  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  32.27 
 
 		 844 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  33.54 
 
 		 856 aa  153  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 776 aa  153  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  42.78 
 
 		 1160 aa  153  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 583 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  45.13 
 
 		 583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.72 
 
 		 1167 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 577 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 		 662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  37.32 
 
 		 505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.39 
 
 		 1190 aa  141  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 601 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  34.66 
 
 		 364 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 792 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 571 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 304 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  43.3 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 1111 aa  140  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 344 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  39.18 
 
 		 483 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 571 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  37.96 
 
 		 561 aa  137  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  37.63 
 
 		 1027 aa  137  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 907 aa  137  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 398 aa  137  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 352 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4536  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 430 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 850 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  31.82 
 
 		 1096 aa  134  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 482 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  29.2 
 
 		 822 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  39.9 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 390 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 1252 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 840 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 		 579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 1096 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4781  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 356 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 356 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 339 aa  128  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 725 aa  128  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 346 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  40 
 
 		 1170 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1022 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 507 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 575 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  39.49 
 
 		 1170 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 759 aa  127  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  42.64 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  34.02 
 
 		 632 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  41.03 
 
 		 872 aa  126  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.46 
 
 		 1061 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  39.7 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  39.5 
 
 		 692 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 553 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0615  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 258 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5369  hypothetical protein  36.2 
 
 		 271 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 384 aa  124  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  37.98 
 
 		 703 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 416 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 465 aa  124  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 500 aa  124  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 409 aa  123  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1483  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 391 aa  123  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 488 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 489 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 454 aa  122  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.94 
 
 		 1063 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 		 1092 aa  120  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 		 733 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>