More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8293 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  100 
 
 		 374 aa  752    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  48.72 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  46.25 
 
 		 331 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  37.76 
 
 		 308 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  54.31 
 
 		 180 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  36.3 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  44.27 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  43.17 
 
 		 388 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.6 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.76 
 
 		 438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  50.91 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  45.31 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  49.15 
 
 		 342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  51.38 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  46.55 
 
 		 345 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  50 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  30.12 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.66 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.48 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.63 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  50 
 
 		 199 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.63 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.24 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  33.87 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  43.7 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  51.79 
 
 		 190 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  33.59 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  34.09 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  41.61 
 
 		 182 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 		 244 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  46.22 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  42.62 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  47.41 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 319 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 501 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  48.31 
 
 		 116 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.38 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1267  lytic transglycosylase catalytic  43.64 
 
 		 176 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  42.02 
 
 		 459 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.09 
 
 		 370 aa  95.9  9e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  43.1 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  41.86 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1103  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.107402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  35.83 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  45.92 
 
 		 269 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 432 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 453 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.53 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3478  lytic transglycosylase  45.63 
 
 		 175 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  37.41 
 
 		 625 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  39.86 
 
 		 177 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  40.16 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 236 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  40.16 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  44.23 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  40.15 
 
 		 447 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  38.98 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  32.75 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  40 
 
 		 177 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 273 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 278 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  41.61 
 
 		 197 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  41.61 
 
 		 177 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  39.16 
 
 		 177 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.08 
 
 		 210 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  48.04 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  43.09 
 
 		 206 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  48.21 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  47.37 
 
 		 199 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  35.88 
 
 		 273 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  35.43 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  40.15 
 
 		 181 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  40.15 
 
 		 181 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  42.61 
 
 		 204 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  43.27 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  39.37 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 284 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  44.64 
 
 		 235 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  38.79 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  34.44 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  41.73 
 
 		 173 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.55 
 
 		 232 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  36.72 
 
 		 281 aa  87  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  38.52 
 
 		 293 aa  86.7  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 291 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  38.57 
 
 		 177 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  40.77 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  40.77 
 
 		 372 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>