More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5814 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0800  helix-turn-helix domain protein  68.82 
 
 		 192 aa  255  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.860069  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03340  predicted transcriptional regulator  69.89 
 
 		 190 aa  244  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  62.77 
 
 		 194 aa  219  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1889  transcriptional regulator, XRE family  52.58 
 
 		 198 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 188 aa  170  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  49.2 
 
 		 196 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04250  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2893  XRE family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3617  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 223 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  42.16 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4050  transcriptional regulator, XRE family  37.58 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  41.01 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  40.11 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  38.51 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  42.29 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0635  transcriptional regulator, XRE family  38.92 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1965  XRE family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0249499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 200 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  40.34 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3652  XRE family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1719  transcriptional regulator, XRE family  40.12 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017651  normal  0.124941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3404  cupin 2 domain-containing protein  40.68 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2365  transcriptional regulator, XRE family  40.49 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.977725  normal  0.0272358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1667  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  36.78 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2592  transcriptional regulator, XRE family  41.34 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  38.51 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1711  transcriptional regulator, XRE family  37.8 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63161  normal  0.919847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  37.99 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5294  transcriptional regulator, XRE family  38.51 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 191 aa  88.2  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3019  transcriptional regulator, XRE family  36.93 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2231  transcriptional regulator, XRE family  35.43 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3829  transcriptional regulator, XRE family  34.66 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  31.44 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  26.16 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2440  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.086441  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  30.07 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  26.06 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  24.6 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  26.06 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  26.78 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  24.84 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  26.06 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  25.53 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  28.48 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  25.53 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  26.37 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  25.53 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  25.53 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  26.99 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  27.61 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  26.99 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  28.8 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  25.42 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  25.42 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  24.2 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  29.59 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  23.4 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>