101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1395 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  100 
 
 		 272 aa  543  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  55.02 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  54.26 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  46.86 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  48.68 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  46.49 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  44.1 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  43.62 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  43.26 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  43.26 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  47.76 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  43.45 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  39.47 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  41.41 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  41.41 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  42.35 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  43.1 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  38.75 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  45.38 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  40.39 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  39.51 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  40.08 
 
 		 292 aa  205  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  40.85 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  40.78 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  38.17 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  40 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  40.39 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  40.39 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  39.06 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  39.26 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  39.26 
 
 		 270 aa  201  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  35.69 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  39.18 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  41.06 
 
 		 288 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  40.23 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  37.46 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  36.36 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  39.34 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  36.92 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  37.12 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  36.9 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  38.03 
 
 		 375 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  37.6 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  37.65 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  35.8 
 
 		 298 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  37.61 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  38.11 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  36.78 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  28.51 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  24.56 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  27.11 
 
 		 866 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  25.73 
 
 		 825 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  27.63 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  27.63 
 
 		 437 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  24.77 
 
 		 901 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  25.74 
 
 		 882 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  25.1 
 
 		 684 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  27.19 
 
 		 437 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  25 
 
 		 658 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  28.27 
 
 		 864 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  24.02 
 
 		 833 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  27.19 
 
 		 888 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.08 
 
 		 601 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  25.33 
 
 		 683 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  23.68 
 
 		 349 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5331  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  24.48 
 
 		 346 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.05 
 
 		 522 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  24.56 
 
 		 833 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  22.3 
 
 		 520 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  22.3 
 
 		 520 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  26.83 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0266  hypothetical protein  30.84 
 
 		 455 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  22.3 
 
 		 520 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  26.72 
 
 		 855 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  23.23 
 
 		 651 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  25.1 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  23.79 
 
 		 846 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  28 
 
 		 840 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4365  ATP-dependent DNA ligase  26.96 
 
 		 886 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  25.15 
 
 		 832 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  24.45 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  27.45 
 
 		 853 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  26.46 
 
 		 930 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  24.78 
 
 		 863 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  36.36 
 
 		 513 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0719  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 537 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  24.48 
 
 		 831 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  26.87 
 
 		 911 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  24.56 
 
 		 833 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  26.86 
 
 		 881 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.88 
 
 		 592 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  25 
 
 		 328 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.84 
 
 		 539 aa  42.7  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1346  ATP dependent DNA ligase  23.86 
 
 		 936 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.893044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6483  ATP dependent DNA ligase  23.86 
 
 		 936 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  33 
 
 		 583 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.6 
 
 		 562 aa  42.7  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  27.97 
 
 		 646 aa  42.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  26.36 
 
 		 343 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  25.19 
 
 		 354 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>