85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3695 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  100 
 
 		 295 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  54.79 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  48.2 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  53.67 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  54.94 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  54.8 
 
 		 337 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  46.05 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  45.82 
 
 		 304 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  46.05 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  53.78 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  44.7 
 
 		 311 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  53.15 
 
 		 306 aa  261  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  54.3 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  50.2 
 
 		 309 aa  258  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  42.7 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  45.96 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  46.82 
 
 		 315 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  48 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  46.27 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  52.16 
 
 		 279 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  45.59 
 
 		 315 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  43.01 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  43.06 
 
 		 281 aa  248  9e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  42.7 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  46.27 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  51.68 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  46.27 
 
 		 279 aa  242  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  49.02 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  51.19 
 
 		 375 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  51.19 
 
 		 326 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  52.59 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  50.2 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  43.82 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  49.61 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  42.19 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  41.33 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  41.49 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  41.25 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  39.67 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  47.97 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  37.27 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  36.4 
 
 		 282 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  33.89 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  36 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  36 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  37.12 
 
 		 266 aa  192  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  34.4 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  36.22 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  27.56 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  25.33 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  32.28 
 
 		 601 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.78 
 
 		 797 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  30.22 
 
 		 831 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  27.4 
 
 		 866 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  28.32 
 
 		 845 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.91 
 
 		 531 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  27.59 
 
 		 883 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  27.78 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 608 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0266  hypothetical protein  32.08 
 
 		 455 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  25.83 
 
 		 1001 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  38.1 
 
 		 845 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.46 
 
 		 588 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  32 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  29.46 
 
 		 825 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  32 
 
 		 547 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  28.02 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  25.08 
 
 		 437 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  24.81 
 
 		 930 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  24.51 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  25.96 
 
 		 851 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3103  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.83 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  26.74 
 
 		 881 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  27.8 
 
 		 847 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.27 
 
 		 552 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  27.09 
 
 		 837 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  30.67 
 
 		 833 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  31.64 
 
 		 847 aa  43.1  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  31.22 
 
 		 684 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56005  predicted protein  26.69 
 
 		 719 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.410085 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  26.71 
 
 		 893 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  30.04 
 
 		 436 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  28.49 
 
 		 644 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  24.1 
 
 		 437 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  31.91 
 
 		 778 aa  42.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>