59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1324 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  46.86 
 
 		 271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  46.89 
 
 		 275 aa  258  7e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  48.02 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  48.63 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  47.24 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  46.85 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  46.46 
 
 		 282 aa  240  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  49.4 
 
 		 312 aa  240  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  44.24 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  41.51 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  44.49 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  41.7 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  41.43 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  43.85 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  41.07 
 
 		 302 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  41.8 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  42.59 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  42.59 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  41.98 
 
 		 315 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  41.98 
 
 		 315 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  39.07 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  41.06 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  42.57 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  41.49 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  38.77 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  40.15 
 
 		 279 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  37.12 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  37.79 
 
 		 306 aa  194  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  41 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  35.74 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  39.51 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  39.02 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  39.04 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  37.15 
 
 		 290 aa  185  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  38.4 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  37.69 
 
 		 317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  34.4 
 
 		 295 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  34.9 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  36.72 
 
 		 303 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  36.25 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  34.25 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  34.11 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  36.13 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  35.04 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  36.13 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  38.3 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  34.67 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1262  ATP dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  25.44 
 
 		 855 aa  50.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  24.72 
 
 		 412 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  24.16 
 
 		 437 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  23.05 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1534  DNA ligase, ATP-dependent  25.32 
 
 		 432 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120841  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0534  ATP dependent DNA ligase  28.3 
 
 		 394 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1374  ATP dependent DNA ligase  26.42 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000452083 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  23.42 
 
 		 437 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  32.79 
 
 		 552 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  22.31 
 
 		 882 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>