61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2369 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  100 
 
 		 279 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  48.02 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  42.76 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  46.27 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  45.42 
 
 		 279 aa  240  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  42.14 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  45.38 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  43.85 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  41.79 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  46.85 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  45.56 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  45.17 
 
 		 309 aa  231  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  43.19 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  43.68 
 
 		 337 aa  229  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  44.32 
 
 		 309 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  44.32 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  44.12 
 
 		 315 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  45.49 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  43.87 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  41.52 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  44.53 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  43.58 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  43.31 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  39.77 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  41.73 
 
 		 282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  43.08 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  39.35 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  42.52 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  43.36 
 
 		 326 aa  205  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  43.36 
 
 		 375 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  40.07 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  41.96 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  42.32 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  41.25 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  35.94 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  36.88 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  36.78 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  38.98 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  37.7 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  41.57 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  32.51 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  32.16 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  32.51 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  36.47 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  37.25 
 
 		 302 aa  171  7.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  35.93 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  34.67 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  33.72 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  27.94 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  25.77 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  26.76 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  29.03 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  29.91 
 
 		 845 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  26 
 
 		 843 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  24.73 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  25.97 
 
 		 864 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  24.46 
 
 		 893 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  25.09 
 
 		 576 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1534  DNA ligase, ATP-dependent  25.21 
 
 		 432 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  24.56 
 
 		 847 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  25.86 
 
 		 840 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>