67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0465 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  62.59 
 
 		 302 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  50.9 
 
 		 275 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  49.46 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  48.68 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  45.77 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  41.51 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  43.26 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  42.91 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  42.91 
 
 		 282 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  41.82 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  40 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  39.22 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  37.89 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  38 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  37.25 
 
 		 282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  38.43 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  38.58 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  34.98 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  36.22 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  35.43 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  35.04 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  34.87 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  37.01 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  36.68 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  36.23 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  36.44 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  37.45 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  34.1 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  35.04 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  36.72 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  34.98 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  35.36 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  33.46 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  35.36 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  34.98 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  36.03 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  34.13 
 
 		 281 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  35.63 
 
 		 337 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  33.59 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  35.32 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  32.33 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  36.65 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  33.85 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  36.65 
 
 		 326 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  34.22 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  33.72 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  30.52 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  24.65 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  25.42 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  30.61 
 
 		 437 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  24.58 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  29.59 
 
 		 437 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  30.08 
 
 		 513 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 520 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 520 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 520 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.83 
 
 		 522 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.41 
 
 		 552 aa  45.8  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1534  DNA ligase, ATP-dependent  25.55 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.3 
 
 		 583 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  26.98 
 
 		 568 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  28.67 
 
 		 534 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  24.32 
 
 		 847 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 513 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  26.98 
 
 		 866 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  33.94 
 
 		 509 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>