191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18701 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  95.19 
 
 		 437 aa  868    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  96.8 
 
 		 437 aa  880    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  78.88 
 
 		 412 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 437 aa  902    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1534  DNA ligase, ATP-dependent  27.13 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120841  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0266  hypothetical protein  26.92 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  24.87 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  28.39 
 
 		 568 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.81 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  28.99 
 
 		 866 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.42 
 
 		 550 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.39 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  25.64 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  25.64 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  25.64 
 
 		 520 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  27.97 
 
 		 837 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  28.29 
 
 		 847 aa  67  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.74 
 
 		 552 aa  66.6  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.62 
 
 		 592 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  23.26 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000184866 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.05 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  27.6 
 
 		 861 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  28.52 
 
 		 583 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.77 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  24.46 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  23.68 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  25.15 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  27.07 
 
 		 851 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.63 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.58 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  26.07 
 
 		 843 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  23.99 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  29.18 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  23.86 
 
 		 831 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  26.09 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.16 
 
 		 601 aa  60.1  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.3 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  25.48 
 
 		 871 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  44.44 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  25.72 
 
 		 508 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  33.33 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  25.29 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  27.08 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  24.46 
 
 		 871 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  28.06 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  24.75 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  29.92 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  26.52 
 
 		 837 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  26.05 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  26.1 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  28.72 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  26.45 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  24.31 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  26.01 
 
 		 758 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  25.4 
 
 		 513 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  25.52 
 
 		 778 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  26.78 
 
 		 603 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  26.23 
 
 		 853 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.1 
 
 		 588 aa  55.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  34.17 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  27.94 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0109  DNA ligase D  26.25 
 
 		 872 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0363186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  26.84 
 
 		 846 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  24.12 
 
 		 503 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  25.25 
 
 		 513 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  26.7 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  26.11 
 
 		 651 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  24.49 
 
 		 549 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.79 
 
 		 590 aa  53.5  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0608  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.67 
 
 		 610 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  26.75 
 
 		 272 aa  53.9  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  25.46 
 
 		 758 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  24.39 
 
 		 354 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  25.46 
 
 		 758 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  26.47 
 
 		 512 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  27.62 
 
 		 832 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  26.86 
 
 		 848 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.67 
 
 		 510 aa  53.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  26.5 
 
 		 833 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  31.16 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  26.4 
 
 		 547 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.4 
 
 		 573 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3852  ATP dependent DNA ligase  27.17 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  26.87 
 
 		 513 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  26.48 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  25.75 
 
 		 350 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  27.87 
 
 		 855 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  24.16 
 
 		 797 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  27.73 
 
 		 551 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  26.07 
 
 		 847 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  26.18 
 
 		 656 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  35.14 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  26.43 
 
 		 828 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  28.39 
 
 		 282 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  26.5 
 
 		 833 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  23.78 
 
 		 818 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.11 
 
 		 594 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  33.33 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  25.9 
 
 		 939 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  25.38 
 
 		 657 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>