65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1841 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  98.23 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  97.52 
 
 		 282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  53.87 
 
 		 312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  46.46 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  40.14 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  43.98 
 
 		 272 aa  228  6e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  41.94 
 
 		 275 aa  225  7e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  40.3 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  39.93 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  42.91 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  40.64 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  39.64 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  42.56 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  39.49 
 
 		 309 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  41.85 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  39.49 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  39.49 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  39.72 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  35.93 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  40.46 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  41.15 
 
 		 266 aa  211  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  40.08 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  41.11 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  39.6 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  38.18 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  36.09 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  38.71 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  40.24 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  37.4 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  37.4 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  35.37 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  38.8 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  36.54 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  39.29 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  36.4 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  37.19 
 
 		 375 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  35.74 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  37.19 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  34.41 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  35.37 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  34.71 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  33.83 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  31.87 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  32.53 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  32.51 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  34.52 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  36.21 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  23.97 
 
 		 797 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  22.58 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  38.96 
 
 		 831 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.21 
 
 		 588 aa  49.3  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  24.24 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  22.53 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  23.45 
 
 		 437 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1400  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  34.91 
 
 		 583 aa  45.8  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  26.09 
 
 		 847 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  31.68 
 
 		 845 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  26.53 
 
 		 763 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  23.11 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  31.96 
 
 		 828 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  27.91 
 
 		 549 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  20.92 
 
 		 522 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  25.75 
 
 		 365 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28 
 
 		 550 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>