22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0266 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0266  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  927    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186221 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  27.4 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  27.34 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  26.49 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  26.27 
 
 		 412 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1534  DNA ligase, ATP-dependent  24.28 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  35.54 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  32.08 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.32 
 
 		 552 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  30.84 
 
 		 272 aa  48.9  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  27.78 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  29.59 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  28.7 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.46 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  28.81 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  25 
 
 		 568 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  25.69 
 
 		 282 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  37.18 
 
 		 303 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  26.85 
 
 		 302 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  29.83 
 
 		 840 aa  43.5  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  26.85 
 
 		 302 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  27.9 
 
 		 847 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>