More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7001 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  447  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  93.21 
 
 		 221 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 210 aa  280  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 205 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  68.56 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  67.51 
 
 		 201 aa  258  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  67.51 
 
 		 201 aa  257  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  67.51 
 
 		 201 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 201 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 204 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 204 aa  254  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  47.64 
 
 		 189 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  46.52 
 
 		 189 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 192 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  41.08 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 179 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 188 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 190 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 187 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 193 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.63 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 196 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 191 aa  95.9  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 188 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 188 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 198 aa  95.5  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 194 aa  95.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 181 aa  95.1  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 185 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 192 aa  92  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 194 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 202 aa  91.7  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 202 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 174 aa  89.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 206 aa  88.2  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 197 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 190 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>