112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6093 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
381 aa  746    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 
370 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  25.09 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
397 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  27.63 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  23.76 
 
 
395 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.57 
 
 
370 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  28.57 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.19 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  29.64 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.55 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  24.47 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  31.49 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  27.13 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.94 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.94 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.43 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  25.25 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  29.86 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  29.21 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  29.41 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  26.86 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
416 aa  69.7  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
191 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  24.68 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  27.57 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
388 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  30.65 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  24.73 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 
229 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  24.62 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  25.99 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  27.6 
 
 
378 aa  59.7  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  25.99 
 
 
386 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.73 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  52.73 
 
 
588 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
381 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  32.8 
 
 
568 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  26.99 
 
 
392 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  49.18 
 
 
586 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  31.52 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
363 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
313 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  24.23 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  39.6 
 
 
578 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  29.38 
 
 
365 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
191 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  29.87 
 
 
369 aa  50.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 
213 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 
213 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  46.03 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 
231 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0531  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 
529 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.614613  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  24.27 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 
188 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
359 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
207 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 
187 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  26.76 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  22.86 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  29.84 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  35.53 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  29.03 
 
 
325 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  36.07 
 
 
231 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>