More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6911 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  99.47 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  99.47 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  96.26 
 
 		 187 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  95.72 
 
 		 187 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 187 aa  270  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  61.5 
 
 		 187 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 196 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  49.7 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  41.62 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 198 aa  98.2  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  31.68 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  30.05 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 188 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 201 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  33.13 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 165 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 600 aa  84.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  26.7 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  26.14 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  26.59 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
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NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  24.31 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
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NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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