More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0112 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  93.2 
 
 		 353 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 353 aa  723    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  99.43 
 
 		 353 aa  716    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  68.56 
 
 		 353 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  68.84 
 
 		 353 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  66.95 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  65.44 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  62.32 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  63.53 
 
 		 352 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  61.19 
 
 		 356 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  61.19 
 
 		 356 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  63.25 
 
 		 352 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  60.06 
 
 		 359 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  63.82 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.91 
 
 		 370 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  59.04 
 
 		 372 aa  430  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  60.4 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.52 
 
 		 353 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  51.43 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  48.31 
 
 		 329 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  50.8 
 
 		 353 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  46.5 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  47.18 
 
 		 363 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  49.22 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  47.26 
 
 		 368 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.29 
 
 		 329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.66 
 
 		 359 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  47.04 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.83 
 
 		 363 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  45 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.9 
 
 		 354 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  47.73 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.17 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  45.79 
 
 		 348 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  45.13 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  45.13 
 
 		 360 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  48.77 
 
 		 328 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  48.29 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  48.29 
 
 		 360 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 348 aa  301  9e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  47.86 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  51.92 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.08 
 
 		 331 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  46.27 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  48.16 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.83 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  47.63 
 
 		 331 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  46.92 
 
 		 329 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  43.79 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.59 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  48.14 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  44.73 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  43.91 
 
 		 349 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  46.78 
 
 		 366 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  48.06 
 
 		 363 aa  298  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0544  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 403 aa  298  8e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0891201  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  44.72 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  45.58 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  47.79 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  49.26 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.88 
 
 		 381 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  49.68 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.38 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45.3 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.06 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  47.24 
 
 		 330 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  49.03 
 
 		 329 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  49.23 
 
 		 350 aa  295  7e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  45.62 
 
 		 339 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  49.03 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  47.92 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  44.11 
 
 		 339 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.9 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  43.06 
 
 		 346 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  47.9 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  49.35 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  50 
 
 		 358 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  51.57 
 
 		 364 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.44 
 
 		 362 aa  293  4e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.04 
 
 		 372 aa  292  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  43.06 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  43.02 
 
 		 348 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  45.43 
 
 		 352 aa  292  7e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  44.57 
 
 		 356 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  43.87 
 
 		 352 aa  292  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.16 
 
 		 379 aa  292  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 367 aa  291  8e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  46.23 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  47.24 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  42.94 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  48.91 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.61 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.92 
 
 		 373 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  51.31 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  45.51 
 
 		 336 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>