More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  100 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  68.83 
 
 
233 aa  324  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  69.4 
 
 
234 aa  321  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  66.96 
 
 
232 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  67.53 
 
 
231 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  67.53 
 
 
231 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  66.09 
 
 
232 aa  314  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  67.11 
 
 
230 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  67.1 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  66.23 
 
 
230 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  67.1 
 
 
231 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  40.79 
 
 
231 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  42.11 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  38.43 
 
 
231 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.72 
 
 
232 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  37.34 
 
 
234 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.09 
 
 
239 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  36.24 
 
 
237 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  41.05 
 
 
227 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  40.44 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.3 
 
 
241 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  39.04 
 
 
230 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.6 
 
 
230 aa  141  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  40.62 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  37.67 
 
 
245 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  36.13 
 
 
249 aa  134  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  37.95 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  36.68 
 
 
238 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  38.05 
 
 
235 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  32.74 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.09 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  37.61 
 
 
240 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  35.81 
 
 
238 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  37.99 
 
 
238 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  38.6 
 
 
231 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
240 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  39.5 
 
 
251 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 
238 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  34.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  34.5 
 
 
238 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  39 
 
 
240 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  38.5 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  33.19 
 
 
238 aa  120  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  34.78 
 
 
240 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
240 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  35.84 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  34.35 
 
 
238 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  34.06 
 
 
238 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  34.06 
 
 
238 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  34.06 
 
 
238 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  34.06 
 
 
238 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
239 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  32.43 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.96 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  32.75 
 
 
238 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  34.06 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
235 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  36.48 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  34.06 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  34.16 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  34.06 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  34.35 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  34.06 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  34.16 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  34.16 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  33.63 
 
 
239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  33.91 
 
 
240 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
240 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.66 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  33.04 
 
 
240 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.37 
 
 
238 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  34.93 
 
 
238 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  31.42 
 
 
247 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
238 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  29.08 
 
 
234 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.18 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  28.16 
 
 
246 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.42 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.4 
 
 
219 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.09 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.07 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  38.1 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  27.69 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.71 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.76 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  37.6 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  36.8 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.88 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  29.9 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.8 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  31.29 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>