158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_25320 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  100 
 
 		 524 aa  1058    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  55.71 
 
 		 550 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  47.72 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  47.23 
 
 		 529 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.99 
 
 		 525 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.04 
 
 		 525 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  45.78 
 
 		 641 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.02 
 
 		 526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  44.83 
 
 		 545 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  41.09 
 
 		 543 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  46.21 
 
 		 562 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  44.28 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  43.09 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  44.8 
 
 		 536 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.93 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  40.94 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  42.37 
 
 		 542 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.92 
 
 		 534 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.45 
 
 		 530 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.16 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  43.71 
 
 		 538 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  43.24 
 
 		 530 aa  348  9e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.13 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 529 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3600  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.29 
 
 		 551 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.270401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  42.4 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.96 
 
 		 570 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.72 
 
 		 547 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  44.1 
 
 		 539 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  40.94 
 
 		 507 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 575 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.57 
 
 		 560 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.57 
 
 		 560 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.01 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.2 
 
 		 560 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  35.75 
 
 		 565 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  35.19 
 
 		 559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.75 
 
 		 575 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1344  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.45 
 
 		 556 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.194528  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 575 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  40.54 
 
 		 627 aa  306  7e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  41.72 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0949  PepSY-associated TM helix domain protein  45.15 
 
 		 560 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  38.27 
 
 		 506 aa  296  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.98 
 
 		 541 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  38.02 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3801  PepSY-associated membrane protein  36.07 
 
 		 529 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  34.77 
 
 		 574 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  40.45 
 
 		 506 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.81 
 
 		 571 aa  283  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1031  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  45.35 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.260826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  38.85 
 
 		 553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3075  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  32.98 
 
 		 557 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.267998  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4163  PepSY-associated TM helix domain protein  31.8 
 
 		 559 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4369  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4235  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.8 
 
 		 559 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  33.08 
 
 		 519 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.52 
 
 		 533 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  27.51 
 
 		 543 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  27.83 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  28.12 
 
 		 519 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.05 
 
 		 525 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  24.56 
 
 		 534 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  27.47 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  22.71 
 
 		 546 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.37 
 
 		 525 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  23.66 
 
 		 555 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.91 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.49 
 
 		 387 aa  97.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0618  PepSY-associated TM helix  24.24 
 
 		 547 aa  95.1  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  24.21 
 
 		 497 aa  93.6  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.01 
 
 		 529 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43081  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.95 
 
 		 374 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.36 
 
 		 539 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  26.58 
 
 		 502 aa  88.6  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.51 
 
 		 539 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  26.28 
 
 		 503 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.28 
 
 		 503 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.06 
 
 		 540 aa  87  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  23.03 
 
 		 539 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  22.83 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.25 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  25.33 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.09 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  24.19 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  24.23 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  22.62 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  26.81 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  23.21 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  23.78 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  24.27 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  23.61 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  24.29 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4729  PepSY-associated TM helix  23.97 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.87 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  23.37 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.04 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0375  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0446  hypothetical protein  27.62 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  22.94 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>