More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2985 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
321 aa  663  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  61.11 
 
 
542 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.88 
 
 
1550 aa  212  8e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  55.11 
 
 
343 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  57.41 
 
 
401 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  60 
 
 
506 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  57.69 
 
 
890 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  51.38 
 
 
442 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  54.43 
 
 
400 aa  189  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  53.51 
 
 
500 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  54.6 
 
 
367 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  52.02 
 
 
438 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  49.18 
 
 
245 aa  186  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  47.78 
 
 
249 aa  184  1e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  52.97 
 
 
500 aa  184  1e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  46.49 
 
 
238 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  48.04 
 
 
249 aa  183  4e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  47.25 
 
 
240 aa  182  5e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  48.04 
 
 
249 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  49.72 
 
 
253 aa  180  3e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  49.72 
 
 
253 aa  180  3e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.18 
 
 
1309 aa  180  3e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.14 
 
 
1224 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  56.69 
 
 
356 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.9 
 
 
465 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.68 
 
 
662 aa  172  8e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  46.33 
 
 
874 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  55.84 
 
 
497 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  50.31 
 
 
363 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5220  putative GAF sensor protein  52.5 
 
 
182 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.583285  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  51.25 
 
 
226 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  49.03 
 
 
599 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  51.25 
 
 
934 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.59 
 
 
1965 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  51.95 
 
 
327 aa  164  1e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  53.46 
 
 
1191 aa  165  1e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  54.43 
 
 
398 aa  165  1e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 
681 aa  164  2e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  49.35 
 
 
320 aa  164  2e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  52.29 
 
 
321 aa  163  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
946 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.05 
 
 
737 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  49.69 
 
 
538 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  50 
 
 
316 aa  162  8e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
1001 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  42.41 
 
 
406 aa  162  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.98 
 
 
837 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  50.3 
 
 
321 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
389 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.92 
 
 
640 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  53.06 
 
 
319 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  51.3 
 
 
595 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  50.98 
 
 
323 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  50.98 
 
 
323 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.98 
 
 
323 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  48.75 
 
 
797 aa  158  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.98 
 
 
323 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  49.67 
 
 
324 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.86 
 
 
323 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.66 
 
 
326 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 
390 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.9 
 
 
864 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
1002 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 
897 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.33 
 
 
322 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  50 
 
 
743 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.15 
 
 
878 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  50.33 
 
 
929 aa  156  5e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.33 
 
 
323 aa  156  5e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.4 
 
 
326 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  47.4 
 
 
325 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  49.67 
 
 
323 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  51.7 
 
 
930 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  50.94 
 
 
829 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  48.98 
 
 
677 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  48.72 
 
 
743 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  51.7 
 
 
930 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  49.67 
 
 
323 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  45.28 
 
 
344 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  46.71 
 
 
416 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.9 
 
 
603 aa  153  3e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  47.17 
 
 
740 aa  153  3e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
943 aa  154  3e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.94 
 
 
348 aa  154  3e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.94 
 
 
348 aa  154  3e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  48.39 
 
 
941 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  42.22 
 
 
732 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.77 
 
 
327 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
653 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04157  histidine kinase-response regulator hybrid protein  47.65 
 
 
306 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.851557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  44.37 
 
 
607 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
635 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
512 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  40 
 
 
1041 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.33 
 
 
728 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  47.26 
 
 
669 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  41.67 
 
 
594 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 
680 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.75 
 
 
624 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
1016 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>