More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1179 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  510  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  66.11 
 
 
264 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  67.8 
 
 
266 aa  338  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  70.46 
 
 
247 aa  338  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  63.86 
 
 
262 aa  329  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  68.33 
 
 
256 aa  328  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  67.09 
 
 
455 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  66.11 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  65.27 
 
 
291 aa  323  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  65.83 
 
 
250 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  67.67 
 
 
255 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  66.38 
 
 
255 aa  321  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  66.96 
 
 
445 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  67.1 
 
 
255 aa  318  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  63.71 
 
 
277 aa  318  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  65.67 
 
 
264 aa  317  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  64.81 
 
 
259 aa  317  1e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  61.73 
 
 
277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  65.33 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  66.38 
 
 
261 aa  311  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  65.29 
 
 
288 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  69.03 
 
 
257 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  65.45 
 
 
312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  62.66 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  63.14 
 
 
258 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.87 
 
 
280 aa  305  3e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  63.11 
 
 
258 aa  304  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  63.56 
 
 
258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  66.39 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  65.79 
 
 
302 aa  297  9e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  63.87 
 
 
252 aa  297  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  63.11 
 
 
263 aa  297  1e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  62.77 
 
 
268 aa  297  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  64.41 
 
 
255 aa  295  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.92 
 
 
274 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  60.42 
 
 
271 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 
279 aa  288  7e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  60.34 
 
 
247 aa  288  8e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  61.5 
 
 
244 aa  278  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  64.41 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  62.67 
 
 
250 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  59.66 
 
 
293 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  60.43 
 
 
257 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
266 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  57.46 
 
 
256 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  55.6 
 
 
279 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.55 
 
 
245 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  56.72 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  58.65 
 
 
277 aa  258  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  54.78 
 
 
243 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  59.45 
 
 
243 aa  254  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  57.81 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  54.94 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  52.12 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  54.07 
 
 
249 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  52.44 
 
 
245 aa  248  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  55.14 
 
 
255 aa  248  8e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  52.12 
 
 
253 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  60.25 
 
 
249 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  50.94 
 
 
228 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  53.56 
 
 
255 aa  234  9e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.69 
 
 
230 aa  233  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.59 
 
 
248 aa  230  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  57.08 
 
 
224 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  54.15 
 
 
272 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  50.7 
 
 
225 aa  230  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.93 
 
 
225 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  50 
 
 
279 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  52.89 
 
 
247 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.36 
 
 
269 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  50 
 
 
244 aa  225  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  48.86 
 
 
229 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 
229 aa  222  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
246 aa  221  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  52.83 
 
 
239 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  45.04 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  51.13 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  46.85 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.75 
 
 
226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
256 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.36 
 
 
230 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  42.98 
 
 
293 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
227 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  215  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  44.5 
 
 
240 aa  215  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  49.1 
 
 
251 aa  214  8e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.93 
 
 
222 aa  214  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  48.88 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  48.18 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  42.74 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  42.74 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  49.08 
 
 
241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
248 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
231 aa  211  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  48.87 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  49.08 
 
 
231 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
255 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  49.53 
 
 
235 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>