111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2923 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 
474 aa  938    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  66.52 
 
 
457 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  67.77 
 
 
458 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  49.78 
 
 
463 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  49.33 
 
 
455 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  49.45 
 
 
452 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  42.76 
 
 
448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  44 
 
 
448 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  40.13 
 
 
469 aa  334  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  43.9 
 
 
444 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  40.52 
 
 
461 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  42.15 
 
 
469 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  41.48 
 
 
432 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  40.76 
 
 
469 aa  310  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  38.74 
 
 
463 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  44.07 
 
 
429 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  38.6 
 
 
437 aa  289  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  40.67 
 
 
449 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  38.34 
 
 
454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  37.04 
 
 
448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  37.07 
 
 
460 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  33.84 
 
 
442 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  36.04 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  35.81 
 
 
428 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  32.67 
 
 
431 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  35.13 
 
 
427 aa  143  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  28.64 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  32.01 
 
 
427 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  32.6 
 
 
419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  32.74 
 
 
423 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  31.85 
 
 
432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  32.41 
 
 
433 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  30.38 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  32.41 
 
 
433 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  32.41 
 
 
433 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  31.63 
 
 
432 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  31.58 
 
 
437 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  31.13 
 
 
422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  29.56 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  29.58 
 
 
429 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  30.99 
 
 
428 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  31.2 
 
 
433 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  30.72 
 
 
437 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  27.07 
 
 
424 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  31.64 
 
 
422 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  33.41 
 
 
423 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  27.78 
 
 
420 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  29.89 
 
 
432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  27.39 
 
 
420 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  27.39 
 
 
420 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  31.22 
 
 
422 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  31.24 
 
 
426 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  25.5 
 
 
417 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  27.39 
 
 
420 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  30.47 
 
 
422 aa  113  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  31.03 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  27.33 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  27.39 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  28.79 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  28.78 
 
 
447 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  30.18 
 
 
425 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  30.67 
 
 
439 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  29 
 
 
404 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  29.72 
 
 
447 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  27.99 
 
 
425 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  29.44 
 
 
455 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  30.58 
 
 
426 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  27.38 
 
 
420 aa  103  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  27.38 
 
 
420 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  29.27 
 
 
437 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  27.6 
 
 
420 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  26.88 
 
 
424 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  29.65 
 
 
455 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  29.65 
 
 
455 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  29.23 
 
 
455 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  26.88 
 
 
424 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  27.15 
 
 
420 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  27.06 
 
 
434 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  29.76 
 
 
424 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  30.34 
 
 
426 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  30.55 
 
 
463 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  27.06 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  27.06 
 
 
434 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  30.93 
 
 
426 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  24.49 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  28.02 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  29.95 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  27.09 
 
 
424 aa  93.2  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  27.58 
 
 
388 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  28.67 
 
 
511 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  29.34 
 
 
466 aa  87.4  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  24.78 
 
 
418 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  31.04 
 
 
416 aa  86.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  29.1 
 
 
417 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  26.13 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  32.6 
 
 
418 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  26.73 
 
 
422 aa  57.4  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0194  putative inner membrane protein  23.38 
 
 
423 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0205992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  26.23 
 
 
439 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>