113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2139 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  100 
 
 		 461 aa  945    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  52.28 
 
 		 469 aa  481  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  41.27 
 
 		 463 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  43.89 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  44.3 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  42.64 
 
 		 455 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  40.6 
 
 		 457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  39.01 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  41.96 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  40.52 
 
 		 474 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  43.97 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  42.54 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  40.44 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  41.59 
 
 		 458 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  41.76 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  43.36 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  37.22 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  40.86 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  37.66 
 
 		 460 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  37.64 
 
 		 448 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  37.42 
 
 		 454 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  35 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  32.03 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  32.03 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  31.14 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  29.8 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  29.63 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  30.3 
 
 		 423 aa  140  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  28.35 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  29.42 
 
 		 429 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  28.45 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  28.14 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  27.53 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  28.04 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  27.89 
 
 		 426 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  27.25 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  27.21 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  27.21 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  27.96 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  27 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  27.21 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  27 
 
 		 420 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  28.8 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  29.26 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  27.13 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  29.23 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  26.36 
 
 		 424 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  28.98 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  27.33 
 
 		 436 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  28.33 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  26.28 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  26.54 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  23.93 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  26.78 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  30.24 
 
 		 424 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  26.22 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  27.47 
 
 		 432 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  28.02 
 
 		 511 aa  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  28.01 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  26.54 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  26.54 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  27.85 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  23.52 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  26.88 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  26.32 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  26.22 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  27.68 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  26.9 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  27.29 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  27.1 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  24.03 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  26.59 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  26.64 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  27.45 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  26.27 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  26.64 
 
 		 434 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  26.27 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  26.27 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  27.18 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  27.27 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  26.43 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  26.34 
 
 		 396 aa  96.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  26.73 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  26.17 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  26.73 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  26.73 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  27.39 
 
 		 463 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  24.17 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  27.62 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  24.17 
 
 		 424 aa  91.3  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  26.75 
 
 		 416 aa  87  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  23.13 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  28.1 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  25.36 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  23.9 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  22.91 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  26.35 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.34 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  23.52 
 
 		 572 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>