99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1068 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1068  type III effector Hrp-dependent outer protein  100 
 
 
463 aa  899    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3436  type III effector Hrp-dependent outers  61.17 
 
 
455 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.211838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1733  type III effector Hrp-dependent outers  62.01 
 
 
452 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2923  type III effector Hrp-dependent outers  49.78 
 
 
474 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0094  type III effector Hrp-dependent outers  50.56 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2419  type III effector Hrp-dependent outers  50.89 
 
 
458 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.962689  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4761  type III effector Hrp-dependent outers  46.61 
 
 
448 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410984  normal  0.655065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4650  type III effector Hrp-dependent outers  46.65 
 
 
444 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3066  type III effector Hrp-dependent outers  43.81 
 
 
448 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2139  type III effector Hrp-dependent outers  44.57 
 
 
461 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.22069  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3064  type III effector Hrp-dependent outers  49.66 
 
 
429 aa  343  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2746  type III effector Hrp-dependent outers  42.58 
 
 
469 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1279  type III effector Hrp-dependent outers  44.87 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11969  normal  0.613819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5643  type III effector Hrp-dependent outer  44.33 
 
 
469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856897  hitchhiker  0.00122307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5258  type III effector Hrp-dependent outer  41.52 
 
 
469 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69157  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1847  type III effector Hrp-dependent outer  39.42 
 
 
463 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0031  type III effector Hrp-dependent outers  41.15 
 
 
449 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3121  type III effector Hrp-dependent outers  34.68 
 
 
437 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1944  type III effector Hrp-dependent outers  40.75 
 
 
454 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.382919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7231  type III effector Hrp-dependent outers  37.42 
 
 
448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0442  hypothetical protein  36.82 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2027  type III effector Hrp-dependent outers  39.29 
 
 
428 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.808425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1449  type III effector Hrp-dependent outers  39.29 
 
 
428 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3217  type III effector Hrp-dependent outers  33.93 
 
 
442 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1738  type III effector Hrp-dependent outers  35.35 
 
 
431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0119414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0111  type III effector Hrp-dependent outers  28.92 
 
 
424 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4551  type III effector Hrp-dependent outers  31.6 
 
 
432 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5074  type III effector Hrp-dependent outers  31.45 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3499  type III effector Hrp-dependent outers  30.99 
 
 
428 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1633  type III effector Hrp-dependent outers  27.15 
 
 
425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0471944  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4424  type III effector Hrp-dependent outers  32.09 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250365  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0117  type III effector Hrp-dependent outers  28.95 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5123  type III effector Hrp-dependent outers  30.72 
 
 
433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1491  type III effector Hrp-dependent outers  28.7 
 
 
420 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5156  type III effector Hrp-dependent outers  30.72 
 
 
433 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426256  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3211  type III effector Hrp-dependent outers  30.72 
 
 
433 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2171  hypothetical protein  30.52 
 
 
436 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5930  type III effector Hrp-dependent outers  29.98 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1426  Type III effector Hrp-dependent outers  30.72 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0125236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0976  YgbK domain-containing protein  30.54 
 
 
447 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0477  Type III effector Hrp-dependent outer proteins  30.26 
 
 
433 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626893  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3142  Type III effector Hrp-dependent outers  31.08 
 
 
422 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1836  type III effector Hrp-dependent protein  29.62 
 
 
422 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425276  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2460  type III effector Hrp-dependent outers  31.17 
 
 
423 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3067  YgbK domain protein  28.31 
 
 
420 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.836536  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3038  YgbK domain protein  28.31 
 
 
420 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1856  type III effector Hrp-dependent outers  31.04 
 
 
425 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3226  YgbK domain-containing protein  28.31 
 
 
420 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2810  type III effector Hrp-dependent outers  30.91 
 
 
427 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4878  type III effector Hrp-dependent outers  29.76 
 
 
427 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289399  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3122  YgbK domain protein  28.09 
 
 
420 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.0402148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3733  type III effector Hrp-dependent outers  30.67 
 
 
437 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3106  YgbK domain-containing protein  28.31 
 
 
420 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3410  type III effector Hrp-dependent outers  30.43 
 
 
437 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5010  type III effector Hrp-dependent outers  30.49 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447343  normal  0.232988 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0891  hypothetical protein  29.65 
 
 
447 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4654  type III effector Hrp-dependent outers  31.29 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0582595  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6836  type III effector Hrp-dependent outers  27.07 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57785  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4319  type III effector Hrp-dependent outers  31.82 
 
 
426 aa  96.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.369903  normal  0.109983 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0148  hypothetical protein  29.36 
 
 
424 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0576  hypothetical protein  29.15 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0465  HopAN1 protein  28.48 
 
 
429 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0439  type III effector Hop protein  29.15 
 
 
455 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2014  YgbK domain-containing protein  29.15 
 
 
455 aa  95.1  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1921  hypothetical protein  29.15 
 
 
455 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282546  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5306  type III effector Hrp-dependent outers  31.19 
 
 
426 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.795374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3383  type III effector Hrp-dependent outers  30.41 
 
 
419 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0133  hypothetical protein  29.36 
 
 
424 aa  93.6  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.875306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1132  type III effector Hrp-dependent outers  31.37 
 
 
424 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0445  type III effector Hrp-dependent outers  30.21 
 
 
423 aa  93.2  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1858  hypothetical protein  28.66 
 
 
463 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3179  type III effector Hrp-dependent outers  30.44 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2087  type III effector Hrp-dependent outers  29.59 
 
 
425 aa  91.3  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2429  type III effector Hrp-dependent outer protein  32.51 
 
 
424 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.668681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2550  type III effector Hrp-dependent outers  23.25 
 
 
417 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170607  normal  0.0125986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5061  HopAN1 protein  28.85 
 
 
404 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.819559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3034  YgbK domain-containing protein  27.75 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0975  type III effector Hrp-dependent outers  27.29 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847022  normal  0.745569 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2875  YgbK domain-containing protein  27.29 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2624  type III effector Hrp-dependent outers  31.39 
 
 
437 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.194247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02587  hypothetical protein  26.86 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5144  type III effector Hrp-dependent outers  30.27 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02552  hypothetical protein  27.27 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1552  hypothetical protein  31.71 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0013  secretion system component  25.23 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04751  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  25.17 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0951  type III effector Hrp-dependent outers  27.43 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2899  hypothetical protein  31.32 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328998  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1458  hypothetical protein  27.29 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.470793  normal  0.510032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2748  hypothetical protein  27.31 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.591939  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2826  type III effector Hrp-dependent outers  27.31 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1025  type III effector Hrp-dependent outers  30.72 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2486  type III effector Hrp-dependent outers  26.5 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1552  type III effector Hrp-dependent outers  27.43 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1111  hypothetical protein  25.11 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2332  type III effector Hrp-dependent outers  27.85 
 
 
416 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.411817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3730  type III effector Hrp-dependent outers  30.24 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0726  Type III effector Hrp-dependent outers  26.16 
 
 
430 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00533743  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  27.59 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>